Das Geschäft in den beiden Sartorius-Konzernsparten verlief im Berichtszeitraum sehr unterschiedlich: Während die Biotechnologie-Sparte, die rund zwei Drittel zum Konzernumsatz beiträgt, dynamisches Wachstum zeigte und beim operativen Gewinn ein neues Niveau erreichen konnte, war die Geschäfts- und Ergebnisentwicklung in der Mechatronik-Sparte erheblich durch den globalen Abschwung belastet. Dennoch schaffte die Sparte im Jahresverlauf die Trendwende und schloss 2009 mit einem positiven operativen Ergebnis ab.
Im Konzern lag der operative Gewinn trotz der schwierigen Rahmenbedingungen über dem Vorjahreswert; der Cash-Flow aus operativer Tätigkeit stieg um mehr als das Zweieinhalbfache. Für 2010 erwartet die Unternehmensleitung steigende Umsätze und Gewinne in beiden Sparten.
Die Biotechnologie-Sparte, die unter Sartorius Stedim Biotech (SSB) firmiert, steigerte ihren Umsatz im Geschäftsjahr 2009 um 9,4 % von 366,0 Mio. Euro auf 400,4 Mio. Euro. Auch der Auftragseingang legte sehr deutlich um 11,5 %. Wachstumstreiber mit zweistelligen Steigerungsraten war erneut das Geschäft mit Einwegprodukten für die biopharmazeutische Industrie. Zusätzliche Impulse setzten im Berichtsjahr die Impfstoffhersteller, die für die Produktion des Vakzins gegen den H1N1-Virus in erheblichem Umfang Einwegbehälter und Filter nachfragten.
Die Mechatronik-Sparte verzeichnete im Berichtsjahr vor dem Hintergrund der ausgeprägten Investitionszurückhaltung in fast allen Abnehmerbranchen eine deutlich verringerte Nachfrage nach ihren Produkten. Dies betraf das Geschäft mit industrieller Wäge- und Kontrolltechnik noch etwas stärker als das Geschäft mit Laborinstrumenten. Das Service-Geschäft zeigte sich hingegen robust. Im Vergleich zum Vorjahr verringerte sich der Sparten-Umsatz um 17,9 % von 245,6 Mio. Euro auf 201,7 Mio. Euro. Auch der Auftragseingang lag mit 205,9 Mio. Euro nach 242,7 Mio. Euro um 15,2 % unter Vorjahr. Nachdem der Nachfrageeinbruch im ersten Halbjahr besonders stark war, zeigte das Geschäft zum Jahresende erste Erholungstendenzen.
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